Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms