Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MVB12AQ96EY5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms