Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms