Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC124Q96CT7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms