Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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