Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms