Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E3Q969T4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms