Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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RABGGTAQ92696 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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RABGGTAQ92696 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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RABGGTAQ92696 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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RABGGTAQ92696 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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RABGGTAQ92696 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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RABGGTAQ92696 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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RABGGTAQ92696 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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RABGGTAQ92696 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RABGGTAQ92696 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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