Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PHF3Q92576 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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