Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms