Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C11orf40Q8WZ69 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms