Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA6DQ8NFY4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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