Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF397Q8NF99 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms