Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF148Q8N7C7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms