Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms