Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
USP43Q70EL4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP43Q70EL4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms