Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KIAA1549LQ6ZVL6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms