Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW02

CYP20A1, Cytochrome P450 20A1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP20A1Q6UW02 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP20A1Q6UW02 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP20A1Q6UW02 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms