Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms