Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBA3EQ6PEY2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms