Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RTL6Q6ICC9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RTL6Q6ICC9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RTL6Q6ICC9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RTL6Q6ICC9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RTL6Q6ICC9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RTL6Q6ICC9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RTL6Q6ICC9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RTL6Q6ICC9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RTL6Q6ICC9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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