Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIGD3Q6B0B8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 4745.8 ms