Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC102BQ68D86 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC102BQ68D86 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms