Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AGAP9Q5VTM2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AGAP9Q5VTM2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AGAP9Q5VTM2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AGAP9Q5VTM2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
AGAP9Q5VTM2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
AGAP9Q5VTM2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGAP9Q5VTM2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms