Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q5VSD8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q5VSD8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q5VSD8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q5VSD8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q5VSD8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q5VSD8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q5VSD8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Q5VSD8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q5VSD8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q5VSD8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q5VSD8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q5VSD8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q5VSD8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q5VSD8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q5VSD8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q5VSD8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q5VSD8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms