Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARHGAP40Q5TG30 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARHGAP40Q5TG30 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARHGAP40Q5TG30 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARHGAP40Q5TG30 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARHGAP40Q5TG30 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARHGAP40Q5TG30 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARHGAP40Q5TG30 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARHGAP40Q5TG30 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARHGAP40Q5TG30 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARHGAP40Q5TG30 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARHGAP40Q5TG30 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARHGAP40Q5TG30 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms