Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FRMPD1Q5SYB0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms