Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LDLRAP1Q5SW96 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms