Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms