Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms