Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC93Q567U6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms