Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIPR1Q53HC9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms