Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC23Q53EV4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC23Q53EV4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms