Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms