Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
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