Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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