Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPP1Q16831 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms