Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUSP6Q16828 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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