Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LAMA3Q16787 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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