Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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