Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PDK4Q16654 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PDK4Q16654 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PDK4Q16654 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PDK4Q16654 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PDK4Q16654 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PDK4Q16654 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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