Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SSX1Q16384 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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SSX1Q16384 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SSX1Q16384 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SSX1Q16384 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SSX1Q16384 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SSX1Q16384 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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