Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6AP1Q15904 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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