Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPTX1Q15818 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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