Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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