Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIP10Q15642 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIP10Q15642 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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TRIP10Q15642 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TRIP10Q15642 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TRIP10Q15642 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TRIP10Q15642 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TRIP10Q15642 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIP10Q15642 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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