Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF4Q15306 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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