Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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