Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SHPRHQ149N8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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