Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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RASGRF1Q13972 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RASGRF1Q13972 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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